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# mashtree
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> 유전체로부터 빠르게 트리를 생성합니다.
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> 계통수를 생성하지 않습니다.
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> 더 많은 정보: <https://github.com/lskatz/mashtree>.
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- fastq 및/또는 fasta 파일로부터 여러 스레드를 사용하여 가장 빠르게 트리를 생성하고, newick 파일로 출력:
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`mashtree --numcpus {{12}} {{*.fastq.gz}} {{*.fasta}} > {{mashtree.dnd}}`
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- fastq 및/또는 fasta 파일로부터 여러 스레드를 사용하여 가장 정확하게 트리를 생성하고, newick 파일로 출력:
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`mashtree --mindepth {{0}} --numcpus {{12}} {{*.fastq.gz}} {{*.fasta}} > {{mashtree.dnd}}`
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- 신뢰값을 포함하여 트리를 가장 정확하게 생성 (참고: `mashtree` 자체의 옵션은 `--` 오른쪽에 위치해야 함):
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`mashtree_bootstrap.pl --reps {{100}} --numcpus {{12}} {{*.fastq.gz}} -- --min-depth {{0}} > {{mashtree.bootstrap.dnd}}`
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